《御赐小仵作》小金鱼的身世是西平公主的儿子。西平公主有两个儿子，但是朝中早就有传言说两个儿子的事情事有蹊跷，而且楚楚也早就发现兄弟二人在骨相上并没有相像之处。通过这些细节可以得知一些信息，兄弟二人其中有一个并不是西平公主的亲生儿子。
通过剧情可以看出，西平公主的驸马是一个心思缜密的人，而公主的二儿子萧瑾瑜就是一个具有超高智慧的人。从遗传基因的角度上来看，他就是西平公主的亲生儿子。西平公主的大儿子萧瑾鲤是一个喜欢舞枪弄剑的人，他的亲生父亲是驸马爷身边的得力助手陈璎将军。
当年驸马和陈璎将军被秦栾陷害，陈璎被敌对势力杀害，而此时他的妻子已经身怀有孕。为了保护他的后代不被伤害，西平公主就收养了他的儿子。朝中有许多官员对于公主双生子的问题持有疑惑的态度，秦栾对此也疑惑不解，但是又苦无证据，因此公主的两个儿子都得以健康的成长。
长大之后的萧瑾瑜与萧瑾鲤一个能文一个善武，他们也成为朝廷中得到重用的重臣，但是兄弟二人一直对父亲的失踪持有疑惑，特别是萧瑾瑜一直暗中调查父亲失踪和当年叛乱的事情。最终在楚楚等人的帮助下，萧瑾瑜揭开了当年事件的真相，让邪恶势力一方最终得到了应有的惩罚。